十三日，在康熙亲政的第六天，苏克萨哈上疏请求解除辅臣之任，愿往遵化守护顺治陵寝，他说如果能够如愿解职守陵，则“如线余生，得以生全”，暗示正是因为鳌拜过于专横，自己才不得不隐退。

苏克萨哈已经卸任，那么鳌拜、遏必隆两人按理也应辞职。这一招触及到鳌拜的要害，可鳌拜却不想就这样退出政治舞台。

鳌拜罗织了二十四条罪状，上奏处死苏克萨哈。

康熙皇帝和孝庄太皇太后面对鳌拜和诸王大臣集体上奏苏克萨哈案及其判断书时，“坚执不允所请”。

鳌拜到康熙面前与之进行辩论，而且一连数日不肯罢休。鳌拜党羽、安亲王岳乐跟着领衔启奏，继续把苏克萨哈往死里整，并当场揭发苏克萨哈曾对康熙有轻蔑之语。在他的推波助澜下，畏惧鳌拜的诸王大臣全都脱下帽子，“免冠叩头”，意思是宁冒着被摘乌纱帽之险，也坚决奏请杀掉苏克萨哈全家。

面对诸臣的跪请，康熙皇帝万不得已，被迫做出让步，同意按原议处置，只将苏克萨哈的凌迟改为处斩。

苏克萨哈除他自己被害外，共被诛四子十二孙。

初七（8月25日），康熙皇帝（14岁）依照规定，开始亲政。康熙皇帝决定废除四大臣辅政体制，实行亲政。

康熙即位之时的四位辅政大臣之首索尼，总掌启奏批红等大权，因病去世。

吴三桂在不得已的情况下，只好以“目疾”为名，具疏请求解除其云贵两省事务。

他的奏疏中带有明显的试探和要挟意味，可是这一伎俩并未奏效，康熙立即降旨，在说着“王久镇严疆，总理两省，勋劳茂著”之类客气话的同时，毫不客气地收回了吴三桂总管滇黔两省的特权。

康熙令吴三桂与云贵督抚、提镇酌情裁兵，共节省额饷百余万两。

朝廷开始限制“西选”，凡吴三桂题补各官，多不准行。

吴三桂上疏说：“今天下大定，文官仍听吏部诠选，臣不敢题请。”殊不料朝廷来了个顺水推舟，正好将吴三桂的用人题补之权裁了个干干净净，之后凡云贵、广东、福建文武官吏的升降、调动，一概收归吏、兵两部管理。

鳌拜集团提出，多尔衮在圈地时偏袒正白旗，不符合祖宗定制，要求镶黄旗与正白旗互换土地。

“互换”的借口下再度掀起圈占土地的逆浪，圈换土地三十一万垧（一垧为十五亩），迁移壮丁六万余人，造成十万人民流离失所，中原社会生产又一次遭到破坏。

16日，廷议将钦天监监正汤若望、钦天监官员刻漏科杜如预、五官挈壶正杨弘量、历科李祖白、春官正宋可成、秋官正宋发、冬官正朱光显以及中官正刘有泰等皆凌迟处死。

但不久天上出现被古人认为不祥之兆的彗星。接着京城又突然发生了大地震，“且一连地震三日，人皆露宿，惴惴不安。”皇宫在地震中遭到破坏，而且有宫殿着火。清统治者视其为上天示警，正所谓“天垂象，示吉凶，圣人则之”。不久以后获孝庄太皇太后懿旨释放汤若望：“汤若望向为先帝所信任，礼待极隆，尔等欲置之死地耶？”汤若望因此得以获释免死。钦天监官员杜如预、杨宏量免死，但是李祖白等五人依然被斩（一说被绞刑）。

孙延龄怂恿孔四贞请求朝廷准许他们出镇广西，康熙帝因为孙延龄是个德才兼备的额驸，而且孔四贞长年生长在军中，熟悉骑射，精通军事，所以授予孙延龄镇守广西的职务，代替缐国安统辖孔有德的旧部。

清廷封孙延龄为上柱国、光禄大夫，世袭一等阿思尼哈番、和硕额附、镇守广西等处将军，孔四贞为一品夫人。并且授予孔四贞郡主的仪仗，和孙延龄一起前去广西出镇。

后来孙延龄夫妇举家南下，孙延龄便渐次排挤了孔四贞，夫妻感情恶化，而且孙延龄渐渐骄纵。

用联姻的方式来促进满蒙联盟一直是清廷国策，清廷以皇室之女下嫁于蒙古王公。

当孝庄太皇太后准备为康熙皇帝举行大婚时，却一改习惯做法，决定从辅臣的女儿中册立皇后——虽然仍是政治联姻，但要联姻的对象已经变成了辅臣及其家族。

因鳌拜飞扬跋扈，其女儿从名单中给剔除。

遏必隆庸懦无主见，其女儿进宫为妃。

索尼在辅臣中被列于首位，其孙女赫舍里氏册立为皇后。

苏克萨哈对索尼看不上他而耿耿于怀，遂力阻册立赫舍里氏为后，遏必隆、鳌拜各怀心思，便也随其一同前往慈宁宫面见孝庄，但孝庄未能撼动。

费扬古之子倭赫是康熙皇帝身边的侍卫，在御前对鳌拜表现得不怎么礼貌，鳌拜对此深为衔恨。

鳌拜遂以倭赫等人擅骑御马、取御用弓矢射鹿之罪名将其处死。费扬古对鳌拜痛恨不已，鳌拜又以“怨望”的罪名，将他及其子尼侃、萨哈连一并处死，家产籍没，给予都统穆里玛（鳌拜之弟）。费扬古一门惨遭家破人亡之祸。

已年过古稀的汤若望突患脑出血致半身不遂，不能正常行走，连说话也含混不清。

清初守旧派官员杨光先趁此机会再度发难，以“历法错误”“传播邪教”“大逆谋反”等罪名，上疏参劾汤若望，要求将汤若望等人“依律正法”。

礼部在收到杨光先奏疏的当天，即上呈四辅臣大臣，辅臣们立即下令，将汤若望、南怀仁等传教士以及几名信奉天主教的钦天监官员逮捕审讯。

汤若望案，因杨光先把发难重点集中于汤若望的“历法错误”，所以也称康熙历狱。

就在这时，北京发生了一场大地震。舆论认为，这次地震是上天的示警，是对汤若望被处以极刑的愤怒与惩罚。紧接着皇宫中突然起火，也同样被视为上天在继续示警。四位辅臣进退维谷，只得一起去面见孝庄，口称：“汤若望罪案，须奏请太皇太后懿旨定夺。”

太皇太后动怒，四个辅臣对汤若望下达了“着免死”的决定，将其和南怀仁等其他传教士陆续予以释放，但仍将五名信仰天主教的钦天监官员处斩，而原居内地的传教士则被一律驱至澳门。

20日，农历春分，康熙皇帝玄烨生母佟佳氏病逝（24岁）。

吴三桂于顺治末年挂大将军印出征云贵，攻打南明永历政权，可是在占领云贵，擒杀永历后，他却没有照规矩归还大将军印。

吴三桂长子吴应熊先前已被顺治皇帝召为额驸，娶顺治皇帝的堂妹建宁长公主为妻，其时正陪伴公主住在紫禁城内。

主持朝政的辅臣们商量一定得把印收缴回来。他们便派内大臣对吴应熊说：“以前永历在缅甸，边疆多事，所以朝廷才把大将军印交给你父亲，为的是重其事权。如今天下大定，你父亲仍据大将军印不还，这是为什么？”

吴应熊心里明白内大臣说的这番话并非其私见，而是代表着朝廷的意图，同时看似规劝，其实话里话外已带着明显的警告意味，这无疑比收印本身更让人感到不安。他立刻向吴三桂进行转达，吴三桂也从中意识到自己非但已失宠于朝廷，而且已见疑于朝廷，如果再顶着压力置若罔闻，绝不会有好果子吃，至此他才怏怏不乐地奏还大将军印。

某将领率部在外，于某地得一罕见的黄鹦鹉，为讨幼帝（康熙皇帝）喜欢，便以黄金作笼，献给康熙皇帝。康熙皇帝不但予以拒绝，而且对将领此举进行了责备。

康熙皇帝遵祖母孝庄为太皇太后，尊生母佟佳氏为皇太后。

1日，吴三桂勒死南明永历帝朱由榔（40岁），南明灭亡

22日，缅王莽白将南明永历帝朱由榔献给吴三桂

初二，顺治皇帝（24岁）痘疹（天花）病重，为祈求康复，清廷采取了多项紧急措施：一是由汤若望建议，以皇三子玄烨（8岁）因“生有异相”且已出过天花具免疫力为由，紧急立为太子；二是在宫中及各庙宇举行大规模祈福仪式，为了祈祝皇上平安度过大难，宫中供奉了痘神娘娘，民间传统的为过春节所挂的春联、已贴的门神、张挂的彩灯全部被撤下；同时谕令全国“毋炒豆、毋点灯、毋泼水”，并发布大赦诏书，以此试图延缓病情。 

初六，上大渐。（“大渐”专指帝王病重病危），朝廷传出谕旨，京城内除了十恶不赦的死囚之外，其他的死罪囚犯一律释放，想以此来为顺治消灾祈福。

初六深夜，急召礼部侍郎兼翰林院掌院学士王熙及原内阁学士麻勒吉入养心殿，口授遗诏。王熙、麻勒吉二人退至乾清门下西围屏内，以初七一天的时间撰拟。一共三次进给顺治皇帝预览，顺治皇帝三次亲自斟酌，刚到晚上才决定。

初七，顺治皇帝逝于养心殿，终年24岁。

顺治皇帝晏驾后，麻勒吉及侍卫贾卜嘉二人手捧遗诏去奏知皇太后，马上向诸王贝勒贝子公大臣侍卫等人宣布。

遗诏立八岁的皇三子爱新觉罗·玄烨为皇太子，继帝位。命索尼（正黄旗）、遏必隆（镶黄旗）、苏克萨哈（正白旗）、鳌拜（镶黄旗）为辅政大臣。

初八日，遣官颁行遗诏于全国。

初九日，玄烨即皇帝位，是为康熙皇帝。

庄氏明史案

十五日，茆溪森本师玉林通琇禅师奉诏到京，听说茆溪森已为顺治帝剃度，勃然大怒，立即命令众人堆积柴火准备烧死茆溪森。

因此他劝顺治帝说：“如果以尘世之法论的话，皇上应该永远坐在皇位上，上可以安圣母皇太后的心，下可以使百姓安居乐业；如果以出世之法论，皇上也应该永久做帝王，对外可以保护操持佛法的人，对内住一切大权菩萨智所住处。”顺治帝听从了他的谏议，同意蓄发，暂时罢了出家的念头。

茆溪森也因此免于被烧死，当月便离开京城回到南方。

顺治帝虽然不再出家，但内心已然完全受到了佛法的熏陶。

十九日，董鄂妃病逝于承乾宫，顺治帝陷入了痛苦之中，而政治上的苦闷也困扰着他。这时只有佛法使他还有所寄托，所以他再萌生出出家之念。

大约在九、十月之交，福临决心出家，由茆溪森剃度。

玉林琇请求回去，福临赐给他黄衣、金印，派遣官员送他回去，并令使者召玉林琇弟子茆溪行森去京师。福临又封憨璞为明觉禅师。

由于憨璞的推荐，福临遣使往浙江宁波天童寺召龙池派另一位名僧木陈忞进京。

玉林琇入京面见福临。福临当即封他为“大觉禅师”，并以禅门师长礼待玉林琇，自称弟子，并请求他起法名。玉林琇再三推辞，福临不许，并要用丑些的字眼命名，玉林琇写了几个字，福临选了一个痴字，法名行痴。

吴三桂等统兵攻占云南省城昆明，从此，两广、云贵基本平定，中原大部得到统一。

清入关前，后金清中央机关无内阁。清军入关，清王朝建立起全国政权，但依旧沿用入关前的内三院制度，未沿袭明制设内阁。

顺治皇帝“斟酌往制”，使名义相符，“共襄化理”，命令“除去内三院秘书、弘文、国史名色”，销毁三院旧印，仿明朝旧制，改称内阁，满文称为多尔吉衙门。

另设翰林院，满文称笔帖黑衙门。内阁大学士俱加殿阁衔，大学士为正五品，低于六部尚书正二品，但大学士多以尚书入阁，所以实际上享受正二品。

大学士品级之低，正说明清统治者还没有把内阁置于总制均衡的地位，以防大学士权力过大。

汤若望被诰封为一品光禄大夫，正式成为顺治皇帝的御用顾问。

在中国历史上，一个西方人能进入官阶制度森严的朝廷为官，还能做到一品大员，是从来没有过的。

朝廷抓住江南拖欠钱粮（赋税）的积弊大做文章，明确宣布：乡绅、进士、举人、生员及衙役，如果拖欠钱粮，按照数量的多少，分别治罪。